Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00032P0C843 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms