Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
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PTPRCP08575 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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PTPRCP08575 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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PTPRCP08575 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
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PTPRCP08575 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
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PTPRCP08575 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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PTPRCP08575 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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PTPRCP08575 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
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