Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTMAP06454 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTMAP06454 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTMAP06454 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTMAP06454 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTMAP06454 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTMAP06454 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTMAP06454 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTMAP06454 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTMAP06454 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTMAP06454 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTMAP06454 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTMAP06454 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTMAP06454 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTMAP06454 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTMAP06454 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTMAP06454 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTMAP06454 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTMAP06454 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTMAP06454 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTMAP06454 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTMAP06454 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTMAP06454 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTMAP06454 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTMAP06454 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTMAP06454 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTMAP06454 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTMAP06454 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTMAP06454 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTMAP06454 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTMAP06454 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTMAP06454 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTMAP06454 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTMAP06454 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTMAP06454 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTMAP06454 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTMAP06454 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTMAP06454 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTMAP06454 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTMAP06454 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTMAP06454 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTMAP06454 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTMAP06454 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTMAP06454 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTMAP06454 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTMAP06454 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTMAP06454 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTMAP06454 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTMAP06454 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTMAP06454 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTMAP06454 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTMAP06454 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTMAP06454 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTMAP06454 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTMAP06454 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTMAP06454 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTMAP06454 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTMAP06454 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTMAP06454 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTMAP06454 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTMAP06454 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTMAP06454 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTMAP06454 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTMAP06454 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTMAP06454 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTMAP06454 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTMAP06454 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTMAP06454 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTMAP06454 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTMAP06454 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTMAP06454 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTMAP06454 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTMAP06454 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTMAP06454 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTMAP06454 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTMAP06454 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTMAP06454 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTMAP06454 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTMAP06454 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTMAP06454 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTMAP06454 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTMAP06454 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTMAP06454 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTMAP06454 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTMAP06454 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTMAP06454 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTMAP06454 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTMAP06454 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTMAP06454 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTMAP06454 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTMAP06454 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTMAP06454 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTMAP06454 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTMAP06454 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTMAP06454 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTMAP06454 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTMAP06454 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTMAP06454 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTMAP06454 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTMAP06454 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms