Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRATO95237 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRATO95237 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRATO95237 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRATO95237 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRATO95237 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRATO95237 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRATO95237 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRATO95237 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRATO95237 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRATO95237 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRATO95237 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRATO95237 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRATO95237 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRATO95237 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRATO95237 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRATO95237 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRATO95237 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRATO95237 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRATO95237 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRATO95237 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRATO95237 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRATO95237 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRATO95237 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRATO95237 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRATO95237 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRATO95237 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRATO95237 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRATO95237 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRATO95237 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRATO95237 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRATO95237 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRATO95237 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRATO95237 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRATO95237 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRATO95237 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRATO95237 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRATO95237 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRATO95237 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRATO95237 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRATO95237 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRATO95237 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRATO95237 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRATO95237 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRATO95237 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRATO95237 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRATO95237 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRATO95237 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRATO95237 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRATO95237 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRATO95237 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRATO95237 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRATO95237 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRATO95237 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRATO95237 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRATO95237 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRATO95237 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRATO95237 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRATO95237 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRATO95237 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRATO95237 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRATO95237 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRATO95237 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRATO95237 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRATO95237 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRATO95237 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRATO95237 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRATO95237 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRATO95237 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRATO95237 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRATO95237 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRATO95237 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRATO95237 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRATO95237 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRATO95237 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRATO95237 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRATO95237 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRATO95237 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRATO95237 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRATO95237 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRATO95237 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRATO95237 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRATO95237 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRATO95237 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRATO95237 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRATO95237 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRATO95237 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRATO95237 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRATO95237 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRATO95237 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRATO95237 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRATO95237 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRATO95237 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRATO95237 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRATO95237 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRATO95237 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRATO95237 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRATO95237 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRATO95237 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRATO95237 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms