Protein–RNA interactions for Protein: O75368

SH3BGRL, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRLO75368 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRLO75368 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SH3BGRLO75368 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SH3BGRLO75368 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SH3BGRLO75368 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SH3BGRLO75368 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SH3BGRLO75368 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SH3BGRLO75368 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SH3BGRLO75368 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SH3BGRLO75368 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRLO75368 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRLO75368 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRLO75368 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRLO75368 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRLO75368 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BGRLO75368 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms