Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB3O43889 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB3O43889 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB3O43889 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB3O43889 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CREB3O43889 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB3O43889 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB3O43889 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB3O43889 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB3O43889 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB3O43889 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB3O43889 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB3O43889 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB3O43889 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB3O43889 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB3O43889 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB3O43889 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB3O43889 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB3O43889 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB3O43889 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB3O43889 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB3O43889 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB3O43889 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB3O43889 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB3O43889 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB3O43889 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB3O43889 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB3O43889 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB3O43889 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB3O43889 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB3O43889 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB3O43889 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB3O43889 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB3O43889 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB3O43889 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB3O43889 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB3O43889 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB3O43889 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB3O43889 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB3O43889 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB3O43889 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB3O43889 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB3O43889 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB3O43889 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB3O43889 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB3O43889 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB3O43889 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CREB3O43889 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CREB3O43889 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CREB3O43889 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB3O43889 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB3O43889 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB3O43889 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB3O43889 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB3O43889 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB3O43889 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB3O43889 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB3O43889 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB3O43889 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB3O43889 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB3O43889 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB3O43889 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB3O43889 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB3O43889 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB3O43889 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB3O43889 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB3O43889 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB3O43889 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB3O43889 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB3O43889 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB3O43889 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB3O43889 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB3O43889 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB3O43889 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB3O43889 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB3O43889 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB3O43889 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB3O43889 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB3O43889 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB3O43889 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB3O43889 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB3O43889 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB3O43889 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB3O43889 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB3O43889 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB3O43889 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB3O43889 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB3O43889 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB3O43889 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB3O43889 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB3O43889 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB3O43889 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB3O43889 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CREB3O43889 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB3O43889 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB3O43889 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB3O43889 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB3O43889 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB3O43889 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CREB3O43889 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms