Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC28A2O43868 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms