Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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