Protein–RNA interactions for Protein: D6REC4

CFAP99, Cilia- and flagella-associated protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP99D6REC4 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP99D6REC4 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms