Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms