Protein–RNA interactions for Protein: C9J3I9

C5orf58, Putative uncharacterized protein C5orf58, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf58C9J3I9 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C5orf58C9J3I9 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms