Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CFAP73A6NFT4 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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