Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms