Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms