Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms