Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms