Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
TNFSF18Q9UNG2 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNFSF18Q9UNG2 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNFSF18Q9UNG2 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNFSF18Q9UNG2 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNFSF18Q9UNG2 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNFSF18Q9UNG2 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNFSF18Q9UNG2 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNFSF18Q9UNG2 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNFSF18Q9UNG2 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TNFSF18Q9UNG2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNFSF18Q9UNG2 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNFSF18Q9UNG2 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNFSF18Q9UNG2 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNFSF18Q9UNG2 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNFSF18Q9UNG2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNFSF18Q9UNG2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNFSF18Q9UNG2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNFSF18Q9UNG2 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNFSF18Q9UNG2 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TNFSF18Q9UNG2 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TNFSF18Q9UNG2 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNFSF18Q9UNG2 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNFSF18Q9UNG2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNFSF18Q9UNG2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNFSF18Q9UNG2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNFSF18Q9UNG2 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNFSF18Q9UNG2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TNFSF18Q9UNG2 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TNFSF18Q9UNG2 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNFSF18Q9UNG2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TNFSF18Q9UNG2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNFSF18Q9UNG2 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TNFSF18Q9UNG2 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNFSF18Q9UNG2 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TNFSF18Q9UNG2 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNFSF18Q9UNG2 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNFSF18Q9UNG2 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNFSF18Q9UNG2 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNFSF18Q9UNG2 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNFSF18Q9UNG2 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNFSF18Q9UNG2 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNFSF18Q9UNG2 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNFSF18Q9UNG2 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TNFSF18Q9UNG2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNFSF18Q9UNG2 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TNFSF18Q9UNG2 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms