Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5BQ9UGL1 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5BQ9UGL1 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms