Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CGGBP1Q9UFW8 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CGGBP1Q9UFW8 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CGGBP1Q9UFW8 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CGGBP1Q9UFW8 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CGGBP1Q9UFW8 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CGGBP1Q9UFW8 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CGGBP1Q9UFW8 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CGGBP1Q9UFW8 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CGGBP1Q9UFW8 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CGGBP1Q9UFW8 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CGGBP1Q9UFW8 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CGGBP1Q9UFW8 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CGGBP1Q9UFW8 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CGGBP1Q9UFW8 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CGGBP1Q9UFW8 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CGGBP1Q9UFW8 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CGGBP1Q9UFW8 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CGGBP1Q9UFW8 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CGGBP1Q9UFW8 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CGGBP1Q9UFW8 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CGGBP1Q9UFW8 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CGGBP1Q9UFW8 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CGGBP1Q9UFW8 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CGGBP1Q9UFW8 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CGGBP1Q9UFW8 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CGGBP1Q9UFW8 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CGGBP1Q9UFW8 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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