Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LHX3Q9UBR4 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms