Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
KLHL9Q9P2J3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL9Q9P2J3 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL9Q9P2J3 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL9Q9P2J3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL9Q9P2J3 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL9Q9P2J3 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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