Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TBCCD1Q9NVR7 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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