Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM30AQ9NV96 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM30AQ9NV96 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM30AQ9NV96 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM30AQ9NV96 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM30AQ9NV96 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM30AQ9NV96 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM30AQ9NV96 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM30AQ9NV96 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM30AQ9NV96 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM30AQ9NV96 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM30AQ9NV96 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM30AQ9NV96 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM30AQ9NV96 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM30AQ9NV96 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM30AQ9NV96 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM30AQ9NV96 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms