Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms