Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX15Q9NRS6 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms