Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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