Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.5 ms