Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL8

BPESC1, Putative BPES syndrome breakpoint region protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPESC1Q9GZL8 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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BPESC1Q9GZL8 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
BPESC1Q9GZL8 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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