Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms