Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms