Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms