Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXM0

PRX, Periaxin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRXQ9BXM0 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms