Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms