Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms