Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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SEC22CQ9BRL7 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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SEC22CQ9BRL7 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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SEC22CQ9BRL7 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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SEC22CQ9BRL7 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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SEC22CQ9BRL7 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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SEC22CQ9BRL7 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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SEC22CQ9BRL7 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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