Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms