Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C9orf85Q96MD7 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms