Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms