Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 BCL2L13-202ENST00000337612 4905 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 APBB1-223ENST00000618005 2107 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 IKZF1-210ENST00000439701 3572 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 TJP2-209ENST00000539225 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 DIS3-205ENST00000545453 3651 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 KCTD10-201ENST00000228495 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 CDC6-201ENST00000209728 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 C9orf3-203ENST00000375315 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 OPRK1-206ENST00000613482 4682 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 CHRNA7-223ENST00000637033 3204 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 PLCXD1-201ENST00000381657 5507 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 UGT3A1-203ENST00000503189 1902 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 PLEC-202ENST00000345136 14803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 AC109454.2-201ENST00000503470 520 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 MTHFR-205ENST00000376592 8378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 SLC38A1-202ENST00000439706 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 KLF6-207ENST00000542957 4537 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 ACOX3-201ENST00000356406 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 AC009227.1-201ENST00000434635 2362 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 RPS6KA1-220ENST00000531382 2359 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 SPTB-204ENST00000389722 10063 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 MPP2-202ENST00000377184 4206 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 ATAD2-201ENST00000287394 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 SLC5A11-201ENST00000347898 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 CDRT4-204ENST00000619038 2498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 PELO-201ENST00000274311 4349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 ARHGEF4-212ENST00000525839 3828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 OSBPL7-202ENST00000392507 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 FAM98A-202ENST00000403368 2818 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 CACNB1-212ENST00000622445 3722 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 PIGM-201ENST00000368090 4319 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 ADAM19-201ENST00000257527 6481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 CNGA3-203ENST00000393504 3841 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 RFX5-215ENST00000452671 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 SHANK2-203ENST00000409161 9208 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 CAGE1-201ENST00000296742 2821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 ZC3H3-201ENST00000262577 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 PCF11-201ENST00000298281 7677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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