Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM41Q8WV44 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms