Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms