Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW19

APLF, Aprataxin and PNK-like factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLFQ8IW19 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APLFQ8IW19 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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