Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms