Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

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Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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ZNF549Q6P9A3 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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ZNF549Q6P9A3 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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ZNF549Q6P9A3 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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ZNF549Q6P9A3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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