Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms