Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms