Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GPAT3Q53EU6 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms