Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC96Q2M329 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC96Q2M329 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms