Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms