Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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